01.00.00 Физико-математические науки

Иркутск

Новосибирский национальный исследовательский государственный университет
Магистратура, 2 курс, факультет: физический

Описание проекта

Хотя ингибирование синтеза E-белка приводит к 20ти - 200-кратному снижению выхода вирусных частиц из клетки, роль его в функционировании вирусных частиц остается не ясна. Блокирование ионных каналов, которые формируют олигомеры E-белка, связывают со снижением репликации коронавирусов. Однако, в связи с неясной до конца ролью E-белка в функционировании и патогенезе коронавирусов в целом и SARS-CoV-2 в частности, требуются комплексные исследования как взаимодействия самого белка с липидной мембраной, так и влияния различных ингибиторов на процесс взаимодействия и на его активность in vitro. Глицирризин, глицирризиновая кислота (ГК) – главное действующее вещество корня солодки. Существует множество данных о её противовирусной активности, в том числе активности против SARS-коронавируса. Кроме того, в последнее время появился ряд работ, указывающих на перспективность применения ГК для терапии SARS-CoV-2. Несмотря на обилие исследований активности ГК против различных вирусов, механизм её противовирусного действия остается неясным. Мы проверим гипотезу таргетного воздействия ГК на E-белок коронавируса. Результаты выполнения проекта позволят понять механизм противовирусного действия ГК и заложить фундаментальную основу для её применения в качестве препарата для лечения. Понимание механизма важно для дальнейшего рационального, эффективного и безопасного применения ГК в качестве средства для терапии, в том числе и для терапии против SARS-CoV-2.

Сейчас

Будет изучено взаимодействие E-белка коронавируса с молекулами липидной мембраны. Проверена возможность нековалетного связывания ГК с молекулой пептида, в случае установления нековалентной связи будет изучена структура получившихся ассоциатов. Будет охарактеризовано влияние ГК на взаимодействия E-белка с липидной мембраной с помощью различных физико-химическими методов (гомоядерная и гетероядерная ЯМР-спектроскопия, динамическое рассеяние света, моделирование методом молекулярной динамики).