Победитель конкурса
"Научная стажировка"

Эмиль
Крюков

Транскриптомный single-cell анализ траекторий симпато-адренальной дифференцировки в норме и педиатрических и взрослых подтипах нейробластомы, параганглиомы и феохромоцитомы

14.00.00 Медицинские науки


Нижний Новгород


Специалитет, 4 курс, факультет: Лечебный


Описание проекта

Мы предлагаем системный подход для характеристики межклеточных взаимодействий в сложных микроокружениях посредством совместного анализа пространственно-разрешённой (2D and 3D spatial transcriptomics) и индивидуально-клеточной транскриптомики (single cell transcriptomics). Мы будем применять его для идентификации сигналов и путей, которые могут подтолкнуть опухоли из нервного гребня (феохромоцитому (PCC), параганглиому (PGL) и нейробластому (NB)) к терминальной дифференцировке. Мы будем использовать профилирование отдельных клеток для отображения на траекторию развития, а пространственный транскриптомный - для идентификации источников сигналов микроокружения, которые направляют дифференцировку клеток в процессе нормального развития. Мы будем идентифицировать факторы, пути и сигналы, которые подтолкнут PCC, PGL и NB к повышенной чувствительности к химиотерапевтическим агентам и приведут к переходу в дифференцированное состояние. Таким образом, очень важно понять основные аспекты развития, которые продвигают линию клеток к терминальной дифференциации. Раковые опухоли, происходящие из нервного гребня, представляют собой убедительную платформу для тестирования нашего подхода, поскольку они являются ярким примером типа опухолей, дифференцировка которых не завершена. Чтобы разработать стратегию возвращения опухолевых клеток к нормальному пути развития, нам необходимо сначала узнать, как клетки развиваются и начинают отклоняться от нормального развития симпатоадреналовой линии.



Сейчас

1. Анализ траектории симпато-адренальной дифференцировки и идентификация межклеточных взаимодействий, определяющих развитие, с использованием транскриптомного анализа. 2. Характеристика внутриопухолевой транскрипционной гетерогенности и микроокружения в различных подтипах опухолей NB, PCC и PGL. 3. Создание карты с траекториями развития для определения стадии дифференцировки и состояния опухолевых клеток. Определение критически важных для дифференцировки сигнальных путей с предсказанием эффекта.