Изучение экспрессии генов паразитов рыб – моногеней рода Gyrodactylus, находящихся на разных стадиях онтогенеза
Институт биологии южных морей имени А.О.Ковалевского РАН
Аспирантура, 2 курс, факультет: гидробиология
Gyrodactylus имеют большое эпизоотологическое значение, так как являются патогенами рыб, в том числе экономически значимых, например, таких как лососевые. По оценке МЭБ гиродактилёз входит в десятку наиболее опасных заболеваний рыб. Одной из проблем является, как раз, присущая способность паразита давать большое количество потомков от одной единственной особи. Соответственно, изучение на молекулярно-генетическом уровне механизмов, запускающих развитие и расселение этих паразитов, имеет большое практическое значение. Однако, число генетических исследований единично и по-прежнему не изучена экспрессия отдельных генов, ответственных за рост, развитие и репродукцию таких значимых патогенов рыб как паразитические черви Gyrodactylus. В данном исследовании поставлена задача исследовать экспрессию генов ответственных за развитие организма и репродукцию на разных стадиях развития Gyrodactylus для описания молекулярно-генетических механизмов регуляции их онтогенеза. Полученные сведения значительно расширят знания об эпидемиологических механизмах заболевания рыб, вызываемого этим паразитом, и в дальнейшем могут быть использованы для разработки методов борьбы и стратегии профилактики гиродактилёзиса. Это особенно значимо в период, когда происходит изменение климата, меняются границы естественных ареалов рыб, активизируется антропогенная интродукция, связанная с аквакультурой экономически значимых видов, что может привести к заносу этого паразита в новые водоемы и популяции хозяина.
На основе полногеномных данных методами биоинформатического анализа будут найдены гены, которые могут являться ключевыми при переходе на половой этап размножения, а также на каждом этапе отрождения эмбриона. Для всех генов будет разработана система праймеров для оценки их экспрессии методом ПЦР в режиме реального времени. Впервые для Gyrodactylus будет изучена экспрессия генов, ответственных за рост, развитие, половое созревание и расселение особей на разных этапах их онтогенеза.